Шутер

Сюжет игры разворачивается в одной арабской стране, где власть захватывает безумный генерал Килбаба — лидер арабских террористов.

Сюжет Jungle Strike начинается с заставки, показывающей двух антагонистов: Ибна Килбабы (сын сумасшедшего диктатора из Desert Strike, намного безжалостнее своего отца) и Карлоса Ортеги (южноамериканский наркобарон, его огромная армия наёмников устроила ему побег из тюрьмы во Флориде). Злодеи с яхты наблюдают последствия ядерного взрыва на необитаемом острове, обсуждая доставку ядерных зарядов и план атаки на Вашингтон. Килбаба стремится отомстить за смерть своего отца от рук США, в то время как Ортега хочет проучить янки, чтобы держались подальше от его наркобизнеса.

проигравший выборы кандидат в президенты США создаёт супероружие, с помощью которого собирается захватить власть над миром. Выясняется, что это наркобарон Карлос Ортега выживший после попадания ракеты в автобус, при попытке сбежать из Вашингтона в прошлой части Jungle Strike. Кроме этого, он объединяет вокруг себя множество сторонников из разных государств. Создавшаяся обстановка угрожает мировой безопасности, и правительство даёт задание пилотам нескольких боевых вертолётов помешать злодею в осуществлении его плана.

Дюк Нюкем возвращается в Лос-Анджелес после событий игры Duke Nukem II. Неожиданно по радио поступает сигнал бедствия: город штурмует ранее неизвестный враг — агрессивная инопланетная раса, прибывшая с целью похищения женщин и использования их тел в качестве инкубатора. Космический корабль Дюка сбивается ракетой, но ему удаётся катапультироваться на крышу дома. Он берётся за оружие и начинает бойню, сметая горы пришельцев на пути к их лидерам. Каждый эпизод имеет свою особенность в сюжете.